Если бы манга Naruto была не позитивным сёнэном, а мрачным комиксом от DC (жёстче, зато интереснее):
Бесконечные войны не прекращаются и выглядят гораздо более кровопролитными.
В отмеску за Изуну убитый горем Мадара душит Тобираму во сне, ослеплённый яростью Хаширама вступает с ним в бой и проигрывает, погибая. Мадаре удаётся захватить Деревню Скрытого Листа, но недовольные этим Учиха восстают и тайком убивают своего бывшего лидера.
Во время обвала Обито получает несовместимые с жизнью раны и погибает.
Данзо убивает Шисуи, забирает оба его глаза и контролирует преемника Хаширамы - Хирузена, верша тайную власть в селении.
Минато, не являясь избранным преемником Хирузена, убивает его и захватывает власть, после чего запечатывает в сыне Кураму, чтобы деревня имела идеальное оружие.
Какаши не может вынести горя потери Обито и Рин и, следуя по стопам отца, кончает жизнь самоубийством.
Итачи уничтожает клан не ради благополучия деревни, а, как он говорил изначально, ради проверки собственных способностей. Став мясником, он не жалеет никого, убивая в том числе и маленького Саске.
Гаара не подавляет ярости Шукаку и, сойдя с ума, убивает отца и, став Казекаге, заливает Скрытый Песок реками крови. Не в силах терпеть подобное, Канкуро и Темари находят способ утопить брата.
Орочимару убивает всех своих подопытных и использует их жизненную силу для поддержания вечной молодости. Его атака на Лист заканчивается успехом, он убивает Минато и вместе с вышедшим из тени Данзо правит селением.
Когда умирает Яхико, Нагато убивает Ханзо на месте и возвращается править Скрытым Дождём не скрываясь, публично. Пейна не существует. Его безумию нет предела, повреждённый рассудок не подлежит восстановлению, и теперь дождь над деревней имеет красный оттенок. Конан покидает его в надежде на лучшую жизнь, чем перспектива провести остаток дней в утопающем в собственной крови городе. Сырость и истощение делают своё - Нагато умирает от болезней, оставляя свою деревню на краю хаоса.
Рок Ли погибает ещё во время экзамена от рук Гаары.
После гибели Дана и Наваки Цунаде решает покончить с собой.
Забуза продолжает считать Хаку лишь оружием, и когда на одной из миссий он встаёт перед моральным выбором, то не колеблясь убивает Хаку.
Покидая Скрытый Песок, Сасори убивает Чиё и делает из неё марионетку, чтобы его последний родственник всегда был с ним.
Дейдара взрывает Скрытый Камень, превращая деревню в руины и убивая её жителей, в числе которых его друзья детства Куроцучи и Акацучи.
Кисаме продолжает работать на жестокого Ягуру, а когда к власти приходит Мей, его длительное время пытают и в конечном счёте убивают.
Какузу расправляется со всем Скрытым Водопадом, то же самое делает Хидан в своей деревне.
Сакура мирится с фактом, что куноичи ей не стать, продолжая вести обычную жизнь.
Саю надоедает подавлять свои чувства, в порыве гнева из-за Шина он бросается на Данзо и, будучи ниндзя куда более низкого уровня, погибает на месте.
Хоть "Акацуки" и не существуют, в мире полно других преступных группировок.
Хвостатые несут лишь смерть и разрушение, являсь истинным воплощением зла и ошибкой Хагоромо, который был убит Хамурой из зависти к его владениям.
Великие державы и мелкие страны погружены в пучину хаоса, никаких соглашений между Каге не действуют, бушует множество локальных конфликтов, которые перерастают в великую войну, точнее даже не войну, а в массовую резню.
На такой войне погибают Неджи и Тентен, а троица "ИноШикаЧо" становится сиротами.
Ниндзя Листа, такие как Киба, Шино, Асума и Куренай, не могут терпеть власти в деревне и дезертируют с поля боя, отправляясь за море в поисках лучшей жизни. Во время шторма их корабль тонет, никто не выживает.
Майто Гай ломает не только ноги, его парализует окончательно.
В этом погрязшем в войне и крови мире маленького Наруто крадёт Ирука и передаёт Джирайе, чтобы тот увёз его подальше и сделал спасителем, который принесёт мир. Джирайя тренирует его в глуши, Наруто живёт всё той же чистой мечтой о титуле Хокаге, надеясь навести в деревне, а то и во всём мире порядок. Его обучению препятствует Курама. В итоге нашедшая путь в мир Кагуя решает погрузить мир в вечную иллюзию, превратив человечество в армию Зецу. Наруто становится единственным, кто не участвует в сторонних конфликтах, и принимает бой. Оцуцуки начинает порабощение мира со Скрытого Листа, превращает деревню в пыль (Орочимару, Данзо, вся гнилая верхушка погибает) и взращивает на руинах корни Древа-Бога. Наруто пытается остановить её, но без особых техник, без даров Хагоромо и без Саске ему ничего не удаётся. Курама отказывается помогать своему Джинчурики, позволяя ему умереть. Впоследствии выжившие в благодарность нарекают Наруто титулом Хокаге посмертно.
Видевшая смерть Наруто Хината не может пережить потери любимого человека и брата, сбрасываясь в реку. Наследницей клана Хьюга становится Ханаби.
В ту же реку бросаются многие, кто хочет избежать участи стать одним из рабов Кагуи, обернувшись Зецу.
В итоге Тонери, исполнявший завет Хамуры, похищает Ханаби, получает Тенсейган и двигает Луну на Землю. Кагуя, собирая жатву с истощённого материка, телепортируется в иное измерение, спасая свою жизнь. Луна сталкивается с Землёй, миру ниндзя в нашем понимании приходит конец.
